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分子对接
分子对接 (molecular docking) is依据配体with受体作用of“锁-钥原理” (lock&key principle) , 模拟配体小分子with受体生物大分子相互作用of一种技术方法.
配体with受体相互作用is分子识别of过程, mainlyincluding静电作用, 氢键作用, 疏水作用, 范德华作用etc.. through计算, can预测两者间of结合模式and亲and力.
分子对接方法of两大课题is分子之间of空间识别and能量识别. 空间匹配is分子间发生相互作用of基础, 能量匹配is分子间保持stable结合of基础. 对于几何匹配of计算, usuallyadopting格点计算, 片断生长etc.方法, 能量计算则using模拟退火, 遗传算法etc.方法. according to简化of程度and方式, can将分子对接方法分for三类. 其中, 刚性对接方法in计算过程中, 参with对接of分子构像不发生变化, 仅改变分子of空间位置with姿态, 其简化程度most高, 计算量相对较小, 适合于process大分子之间of对接.
分子对接方法不仅in药物设计and发现领域得到了广泛应用, 还inenzyme发现with催化领域发挥了important作用. for example, through分子对接, can预测小分子化合物withenzyme之间of结合模式and亲and力, 从而screen出具have潜in催化活性of化合物, forenzymesubstrateof发现provide理论指导.
need撰写需求文件, 说明分子对接需求, 并提前with工程师沟通联系.
一, such as果计算结果with预期不符合怎么办?
1.科研计算服务is一pcs探索of过程, 其中存in不确定性. 服务方对理论计算得到of数据负责, 但不保证理论数据be able towith预期结果完全一致. such as果needcan对模型进行适当调整, 调整过程中若增加计算or大规模of重新计算, 需增加计算费用, 价格另行协商.
2.模拟计算存in不确定性, we对计算过程of正确性负责. 计算开始之后会消耗软件, 机时as well as人力成本, 所以不支持退款, 敬请谅解
二, 模拟计算项目服务范围?
1.计算完成之后provide所需of计算方法, 计算结果数据and图文, as well as关于计算结果中疑问ofAnswer;
2.文章回复意见中模拟计算Question进行适当ofAnswer, 若返稿后need增加计算, 需另行收费.
三, 关于模拟计算下单流程is怎么样of呢?
1.such as果is确定计算需求, can直接in测试狗官网选择相应of项目进行下单, 提交订单时需填写具体of计算内容, 预期结构, 分子结构及相关of参考文献. such as果网站上没have对应of项目请选择 [私人定制] 并in需求中写明具体计算内容;
2.such as果不能确定计算内容, can直接联系工作人员进行需求沟通.
