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Project Introduction

项目定义

空间代谢组isbased on质谱成像技术发展而来of, 免标记, 无需基质, weeks期短. through质谱成像技术对不同tissue器官中of代谢物进行定性, 定量, 定位三pcs维度ofanalyze, 突破传统代谢组research损失空间信息of瓶颈. 空间代谢组学作for一种新型of分子影像技术, be able to直接从生物tissue中获得大量已知或未知of内源性代谢物and外源性药物etc.分子of结构, 含量and空间分布信息.


空间代谢组学作for一种新型of分子影像技术be able to直接从生物tissue中获得大量已知或未知of内源性代谢物and外源性药物etc.分子of结构, 含量and空间分布信息. 相对于其他成像方法 (such as荧光成像, 放射性标记成像etc.) , 该技术无需化学或放射性标记, 不需复杂样品前process, 具have高Specificity, 高通量and空间信息保留of突出优势. 质谱成像技术can实现生物tissue中上千代谢物of定性, 定量and定位analyze, 结合生物信息学analyze, 发展for空间代谢组学方法, 可从生物tissue原位发现差异代谢物, 并识别其生物学功能.


技术流程


从样本接受到空间代谢组学of标志物screen

(1) in电喷雾毛细管喷嘴上施加一定高电压, 喷雾溶剂从雾化器of内套管中流出, 由外套管中喷出of高压氮气迅速将喷雾溶剂雾化形成带电喷雾液滴;

(2) 喷出of高速带电液滴轰击待测样品表面, in溶剂萃取作用下样品同时被解吸with电离;

(3) 含have被测样品of带电液滴迅速发生去溶剂化作用, 从质谱analyze器of采集锥孔进入analyze器并被detect;

(4) 样品固定in承载平台, 连续或脉冲移动承载平台对样品进行二维扫描;

(5) 同时质谱仪record质谱信号强度获得样品表面of分子及其含量;

(6) 这些信息through质谱图像analyze软件转换后, 即可获得选择离子或离子群of二维空间强度分布图


常见质谱成像技术区别


类型

AFDESI-MSI

EDSI-MSI

MALDI-MSI

样本类型

新鲜tissue

新鲜tissue

新鲜tissue

可detect样本大小

5mm*5mm~2cm*4cm; 可测量整只小鼠/大鼠of切片

大至7.5cm~2.5cm (一张载玻片)

大至7.5cm~2.5cm (一张载玻片)

detect物质类型

1000Da以下of小分子代谢物: 胆碱类, 多氨类, 氨基酸类, 肉碱类, 核苷类, 核苷酸类, have机酸类, 碳水化合物类, 胆固醇类, 胆酸类, 脂质类etc.多种类代谢物

1000Da以下代谢物, 偏向脂质

protein, 多肽, 脂质

空间分辨率

100um*100um, 20um*20um

50um

5-50um

质量分辨率

according to链接of质谱仪

according to链接of质谱仪

according to链接of质谱仪

is否need基质

is

基质影响

对小分子代谢物detectof抑制较严重


应用方向


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Project Cases

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Sample Requirements

样本类型

       未经过福尔马林浸泡, HEstain, 荧光标记etc.processof新鲜tissue样本;

       小至直径2mm*2mm, 大至整只大鼠, 小鼠 (15cm×10cm) . 常规样本大小for1cm3左右;

送样准备

(1) 实验前准备

        预冷生理盐水50mLcentrifuge管中, 封口膜或保鲜膜, 锡箔纸, 干冰, 液氮, 滤纸片, 镊子, 记号笔etc.;

(2) 样本process流程

(3) 送样流程

        干冰寄送时, 将样本盒埋没于干冰中, 保证其上下都have干冰覆盖; 干冰of量according to每days4公斤来计算, using厚实 (2cm以上厚度) of泡沫箱寄送.

(4) 送样note事项

        in允许of条件下, recommend多准备一copies样品作for备用;

       样本质量is影响Experimental Resultsofmost关键因素, 因此in采集, 制备, 贮存, transport过程中应尽可能地做到迅速, most大限度of缩短样本从采集到实验of时间.


FAQ

    空间代谢组generallyrecommend多少生物学重复?

          对于pcs体差异relatively小of样本类型生物学重复recommend每组至少3重复;

          对于群居性较大型动物 (牛, 羊, 猪etc.) , recommend5重复;

          对于临床样本, pcs体差异very大, recommend每组≥5重复;

    tissueneed灌流process吗?

           recommend不进行灌流, 灌流液have可能带走一些水溶性of代谢物, 灌流力度不合适, 也会造成tissue结构of改变. 但若不考虑水溶性代谢物or想要排除血液中代谢物, 那么can考虑灌流.

    such as何选择合适of切面?

           切面取决于clientofresearch目of, 切片need涵盖research关注of区域, especiallyis像脑tissueetc.具have复杂结构oftissue或have特殊要求of. recommendclient到公司共同完成切片of过程, 提高切片of成功率, 也减少中间沟通of时间成本; 像肿瘤tissue, most好能包含癌, 癌旁and癌远端tissue, generally选择most大截面进行切片.


 
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