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虚拟screen (Virtual Screening, 简称VS) 也称for计算机screen, is一种based on药物设计理论, 借助计算机技术andprofessional应用软件, 从大量化合物中挑选出一些have苗头of化合物, 进行实验活性evaluateof方法. 其mainly目ofis从几十pcs乃至百万pcs分子中screen出新of先导化合物, 以降低实际screen化合物数目, 同时提高先导化合物发现效率.
虚拟screen技术can分forbased on受体of虚拟screenandbased on配体of虚拟screen. based on受体of虚拟screen从靶proteinof三维结构出发, research靶protein结合位点of特征性质as well as它with小分子化合物之间of相互作用模式, most终从大量of化合物分子中挑选出结合模式relatively合理of, 预测得分较高of化合物, 用于后续of生物活性测试. 而based on配体of虚拟screengenerallyisutilizing已知活性of小分子化合物, according to化合物of形状相似性或药效团模型in化合物数据库中搜索be able towith它匹配of化学分子结构.
in科研过程中, 虚拟screenbe able tohave效地and实验互补, 提高论文逻辑合理性as well as文章质量. through虚拟screen, research人员canin实验室实际合成and测试化合物之前, through计算机模拟of方式预测化合物of生物活性, 药理学性质and毒理学特性, 从而减少药物研发of时间and成本.
虚拟screen技术in计算机辅助药物发现 (Computer Aided Drug Design, 简称CADD) 中发挥着关键作用, 其inscreen药物方面ofhave效性得益于先进of计算能力of崛起and大规模生物分子数据集of可用性, 从而加速了药物发现of进程. 据报道, 虚拟screenof阳性率for5%~30%, utilizing虚拟screen成功辅助药物设计of案例逐年增多, 使其已成for目前mosthave潜力of药物develop工具.
靶点调研: 这is虚拟screenof第一步, need对目标靶点进行深入ofresearch, 了解其结构and功能, as well asis否have已知of参考药物and结合模式信息. 这些信息is后续建立screen模型of基础.
screen模型建立: based on靶点proteinof结构, 结合已haveof药物结合信息或预测of药物结合模式, 建立合适ofscreen模型. screen模型of精确性andreliable性对于虚拟screenof成功至关important.
化合物库选择: 化合物库of选择直接影响到虚拟screenof结果. 应从FDA现haveof药物库, 其他类药化合物库或易于购买of化合物中获取, 确保化合物库of多样性and质量.
screen模型精度选择: 这including静态ofproteinwith化合物of分子对接, as well as动态ofproteinwith化合物ofMD自由能计算. according toresearch目标and需求, 选择合适of精度进行screen.
虚拟screenwith实验validate相结合: 虚拟screenof结果needthrough实验validate来confirm其have效性. through购买化合物进行Assay实验, 找到满意of潜in药物或继续optimize活性.
避免常见误区: in虚拟screen过程中, need避免一些常见of误区, such as过度依赖计算机预测结果, 忽视实验validateofimportant性; or忽视化合物of生物可utilizing性andsafe性etc.Question.
一, such as果计算结果with预期不符合怎么办?
1.科研计算服务is一pcs探索of过程, 其中存in不确定性. 服务方对理论计算得到of数据负责, 但不保证理论数据be able towith预期结果完全一致. such as果needcan对模型进行适当调整, 调整过程中若增加计算or大规模of重新计算, 需增加计算费用, 价格另行协商.
2.模拟计算存in不确定性, we对计算过程of正确性负责. 计算开始之后会消耗软件, 机时as well as人力成本, 所以不支持退款, 敬请谅解
二, 模拟计算项目服务范围?
1.计算完成之后provide所需of计算方法, 计算结果数据and图文, as well as关于计算结果中疑问ofAnswer;
2.文章回复意见中模拟计算Question进行适当ofAnswer, 若返稿后need增加计算, 需另行收费.
三, 关于模拟计算下单流程is怎么样of呢?
1.such as果is确定计算需求, can直接in测试狗官网选择相应of项目进行下单, 提交订单时需填写具体of计算内容, 预期结构, 分子结构及相关of参考文献. such as果网站上没have对应of项目请选择并in需求中写明具体计算内容.
2.such as果不能确定计算内容, can直接联系工作人员进行需求沟通.
